1、制備含MMP底物蛋白的SDS-PAGE凝膠：推薦分離膠濃度為8%。分別在濃縮膠和分離膠中額外加入10×substrateG并使之稀釋10倍，混勻后加入過硫酸銨和TEMED，等待凝膠聚合。
2、待測樣品：切勿加熱變性，并且僅使用不加還原劑的上樣緩沖液。可通過預試驗確定加樣量，使用普通蛋白預染Marker即可。
3、低電流恒流電泳，每一塊小膠電流為20mA/gel。溴酚藍跑出凝膠前沿時結束電泳。
4、洗滌凝膠：取出凝膠，去除濃縮膠，放入容器內.可先用適量蒸餾水沖洗凝膠，然后加入10ml1×BufferA(用蒸餾水稀釋)，室溫漂洗凝膠2×30分鐘。中間換液。
5、孵育：加入10ml1×BufferB(蒸餾水稀釋)，室溫或37ºC孵育1~5小時。陽性對照或者血中的MMP通常37ºC孵育1小時即可顯示。如MMP活性低，應延長孵育時間為10小時或過一夜。
6、顯色：倒掉BufferB，加入凝膠蛋白質考馬斯亮藍染色液。凝膠的大部分區(qū)域被深染，在有MMP條帶的位置不被染色而形成透亮區(qū)域。透明區(qū)域的位置和范圍指示MMP-2、MMP-9的大小位置(酶譜)及活性。
7、條帶掃描：將凝膠放在掃描儀上掃描。雖然MMP條帶透明，但凝膠背景并非真正全黑。解決辦法：可用非透射光掃描，或用軟件圖像處理程序調整背景顯示為灰度顯示，并盡量設置為黑色.MMP條帶則為白色。
更新時間：2022-08-27 
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